São órgãos do INFARMED, I. P.:
Comissões Técnicas Especializadas;
Conselho Nacional de Publicidade de Medicamentos e Produtos de Saúde.
São unidades orgânicas do INFARMED, I.P.:
Funções de Negócio
Direção de Avaliação de Medicamentos (DAM);
Direção de Gestão do Risco de Medicamentos (DGRM);
Direção de Produtos de Saúde (DPS);
Direção de Inspeção e Licenciamentos (DIL);
Direção de Comprovação da Qualidade (DCQ);
Direção de Avaliação das Tecnologias de Saúde (DATS);
Direção de Informação e Planeamento Estratégico (DIPE);
Gabinete de Relações Internacionais e Desenvolvimento (GRID);
Unidade de Projetos Interinstitucionais e para o Sistema de Saúde (USS).
Funções de Suporte
Direção de Sistemas e Tecnologias de Informação (DSTI);
Direção de Recursos Humanos, Financeiros e Patrimoniais (DRHFP);
Direção de Gestão de Informação e Comunicação (DGIC);