A utilização de medicamentos manipulados pode consistir na preparação individual de um medicamento (fórmula magistral) destinado a um dado doente por prescrição do médico segundo receita médica que especifica o doente a quem o medicamento se destina; ou pode traduzir-se na utilização de um medicamento manipulado, preparado para vários doentes, (preparado oficinal) realizada antecipadamente, sob a forma de preparação multidose e distribuído em multiplas embalagens para dose única.
O médico ao prescrever uma fórmula magistral deve certificar-se da sua segurança e eficácia verificando a possibilidade de existência de interacções que coloquem em acção do medicamento ou a segurança do doente.