O Departamento de inspecção assegura a observância das boas práticas na preparação de medicamentos manipulados preparados nas farmácias de oficina e nos serviços farmacêuticos hospitalares, visando criar um padrão elevado de qualidade destes medicamentos.
Medicamento manipulado – qualquer fórmula magistral ou preparado oficinal preparado e dispensado sob a responsabilidade de um farmacêutico.
Os estabelecimentos hospitalares podem mediante autorização do Infarmed contratar entidades portadoras de uma autorização de fabrico, para a preparação destes preparados destinados a ser utilizados exclusivamente naqueles estabelecimentos, desde que estejam autorizados para a forma farmacêutica pretendida.